Isolement et screening des actinobactéries à partir des écosystèmes extrêmement salins
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Date
2020
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Publisher
Université Oum El Bouaghi
Abstract
Historiquement, les actinobactéries ont reçu beaucoup d'attention en raison de leur capacité à produire diverse métabolites secondaires de valeur biotechnologique intéressante. D'autre part leur caractère ubiquitaire et surtout leur présence dans des environnements extrêmes tels que les habitats hypersalins les a donnée une attention particulière.
Au cours de ce travail, nous avons essayés de donner un aperçu général sur la démarche d'isolement des actinobactéries halophiles et halotolérants, les milieux utilisés, leurs compositions et notamment les sources de carbone et d'azote, les genres les plus rencontrés dans ces écosystèmes particuliers. Une étude bibliographique étendue sur 100 articles scientifiques a rendu possible cette tache. En général, l'isolement d'un tel ou tel microorganisme nécessite la mis en œuvre d'un protocole adéquat où le milieu d'isolement joue un rôle primordial. Au cours de cette étude nous avons constaté que les milieux de culture ISP 5, CCMS et SCA sont fréquemment utilisés dans l'isolement des actinomycètes à partir des écosystèmes salins, additionnés de différentes concentrations de NaCl, selon les exigences de l'espèce isolée.
Il est à noter que l'amidon et la caséine représentent les meilleurs sources de carbone et d'azote pour l'isolement de certains genres présent dans ce type d'écosystèmes, nous citons : Nocardiopsis, Actinopolyspora, Nesterenkonia, Streptomonospora, Saccharopolyspora…etc.
Ainsi, nous avons abordé dans ce travail plusieurs notions théoriques essentielles, en débutant par la collecte, l'analyse physicochimique et le prétraitement des échantillons, les différentes procédures d'isolement sélectifs, les méthodes de criblage et d'évaluation de l'activité antimicrobienne, enfin la fermentation et l'extraction ont été aussi rapporté, en discutant les avantages et les limites de chaque méthode.
Description
Keywords
Extraction, Fermentation, Isolement, Actinobactérie, Habitat hypersalin