Browsing by Author "Meradi, Laarem"

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    Caractérisation de la résistance aux antibiotiques des souches bactériennes isolées de plusieurs biotopes
    (Université De Larbi Ben M’hidi Oum EL Bouaghi, 2023) Rahmani, Amina; Meradi, Laarem
    La résistance aux antimicrobiens (RAM) représente l'un des plus importants problèmes de santé humaine et animale dans le monde et particulièrement en Algérie. Le but de cette étude est de faire une caractérisation phénotypique et moléculaire des souches Gram positives et Gram négatives isolées de différentes origines (alimentaire et clinique). La détermination du profil de sensibilité aux antibiotiques de chaque souche bactérienne a été réalisée en utilisant la méthode de diffusion des disques d'antibiotiques, selon les recommandations de la Société Française de Microbiologie (SFM, 2019). La caractérisation moléculaire des souches multirésistantes de K. pneumoniae a été réalisée afin de séquencer le génome entier (WGS) en utilisant la technologie Illumina. Les lectures brutes séquencées ont été traitées en utilisant des outils bioinformatiques : FastQC Ariba, Shovill-Spades. Le typage de séquence multilocus (MLST) a été utilisé pour estimer la relation évolutive entre les souches séquencées. La caractérisation phénotypique a révélé des taux de multirésistance (MR) aux antibiotiques élevés et très inquiétants chez les souches d’E. coli, S. epidermidis et S. aureus. L'analyse moléculaire a permi de détecter pour la première fois en Algérie le gène blaNDM-5 chez K. pneumoniae. D’autres gènes de résistance ont été aussi détectés : blaTEM, blaSHV, blaCTX-M, aac(6')-Ib-cr, qnrB1, qnrB4, qnrB19, qnrS1, gyrA et parC. En outre, nos données révèlent aussi l’émegence de clone ST307 chez deux souches de K. pneumoniae (S03 et S13), qui maintenant, est reconnu comme une grande menace mondiale. Pour conclure, en Algérie de nouvelles politiques de contrôle doivent être adoptées Antimicrobial resistance (AMR) represents one of the most important problems of human and animal health in the world and particularly in Algeria. The aim of this study is to make a phenotypic and molecular characterization of Gram-positive and Gram-negative strains isolated from different origins (food and clinical). The determination of the antibiotic susceptibility profile of each bacterial strain was performed using the antibiotic disc diffusion method, according to the recommendations of the French Society of Microbiology (FSM, 2019). Molecular characterization of the multidrug-resistant strains of K. pneumoniae was performed to sequence the whole genome (WGS) using Illumina technology. The raw sequenced reads were processed using bioinformatics tools: FastQC Ariba, Shovill-Spades. Multilocus sequence typing (MLST) was used to estimate the evolutionary relationship between the sequenced strains. Phenotypic characterization revealed high and very alarming rates of multidrug resistance (MDR) to antibiotics in E. coli, S. epidermidis and S. aureus strains. Molecular analysis has permitted to detect for the first time in Algeria the blaNDM-5 gene in K. pneumoniae. Other resistance genes were also detected: blaTEM, blaSHV, blaCTX-M, aac(6')-Ib-cr, qnrB1, qnrB4, qnrB19, qnrS1, gyrA and parC. In addition, our data also reveal the emergence of clone ST307 in two strains of K. pneumoniae (S03 and S13), which is now recognized as a major global threat. To conclude, in Algeria new control policies must be adopted.
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    Valorisation des molecules bioactivesayant une activite sur le metabolisme de resistance des souches cliniques
    (Université d'Oum El Bouaghi, 2021-12-13) Rahmani, Amina; Meradi, Laarem; 1, Benslama, Ouided
    L'évolution constante de la résistance bactérienne aux antibiotiques justifient l'urgence de l' Organisation Mondiale de la Santé d' évoquer un plan mondial pour combattre la résistance aux antimicrobiens en soutenant le développement des projets de la biotechnologie pharmaceutique et agroalimentaire qui s'appuient sur l'utilisation de molécules bioactives produites par des souches microbiennes. Alors, ce travail consiste à isoler des souches cliniques identifié es: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus et Bacillus cereus et d' identifier leur capacité à croitre en présence de molécules bioactives produites par des souches telluriques d' actinomyc è tes. L' identification des souches a été réalisée par les méthodes de microbiologie classique. La méthode de diffusion des cylindres d' agar a été utilisée pour la réalisation de l' antibiogramme sur gé lose Mueller-Hinton selon les normes NCCLS (National Committee of Clinical Laboratory Standards, 2019). Les résultats révèlent qu' E. coli est sensible aux substances bioactives produites par 16 isolats d' actinomyc è tes alors que S. aureus en est résistant. Tandis que les résultats obtenus sur l' extrait brut produit par les actinomyc è tes dé montrent que toutes les souches utilisé es ont pu pousser en présence de ces molécules bioactives mais avec des diam è tres vari é es. Cette résistance pourrait s'expliquer par une pression de sélection des bactéries due à la présence d'antibiotiques et d'autres molécules pouvant contaminés les sols et altérer la santé du consommateur en contaminant les aliments crus. D'où l'importance de mettre en place des mesures de contrôle microbiologique