Browsing by Author "Benslama, Ouided"

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    Criblage du potentiel de biocontrôle dedifférents isolats microbiens
    (Université De Larbi Ben M’hidi Oum EL Bouaghi, 2023) Mansouri, Nedjwa; Benslama, Ouided
    Dans cette étude, 68 souches fongiques et 30 souches actinomycétales ont été isolés à partir de trois sols agricoles dans le but d’évaluer leur activité de biocontrôle in vitro et in planta contre trois souches d’Alternaria sp. isolées à partir des fruits de tomates infectées. En utilisant le test de confrontation directe, 9 isolats fongiques et un isolat actinomycétale ont présenté des taux d’inhibition de la croissance mycélienne des souche d’Alternaria variant entre 53,33% et 92%. La caractérisation micro-macroscopique des souches actives a permet leur attribution aux genres Aspergillus, Penicillium et Streptomyces. L’analyse des potentiels enzymatiques montrent que les souches antagonistes possèdent un arsenal enzymatique lié au biocontrôle incluant les enzymes amylase, protéase, cellulase, lipase, estérase, pectinase, laccase et chitinase. Les filtrats de culture de fermentation des trois souches fongiques les plus performantes ont montré des taux d’inhibition de la croissance d’Alternaria variant entre 3,70% et 87,76% pour différentes concentration 10%, 20% et 40%. Dans le test in planta sur les tomates, ces filtrats ont présenté des taux d’inhibition de la taille de l’infection variant entre de 55,56 % et 100%. Les structures 3D des enzymes clés impliquées dans la virulence d’Alternaria cystathionine béta lyase, homoserine O-acétyltransférase, glutathione réductase, pecate lyase, scytalone dehydratase, thioredoxin peroxidase, thioredoxin réductase, 3HNR et 4HNR ont été modélisées et leur qualité a été validées. 113 métabolites secondaires actinomycétales et 100 fongiques ont fait l’objet d’une analyse de leur activité inhibitrice contre les enzymes modélisées par docking moléculaire. Les résultats ont permis la sélection d’un nombre important de molécules avec une éventuelle activité antifongique. Une analyse pharmacocinétique des caractéristiques Drug Likeness et ADMET des métabolites prometteurs a permis de comprendre leur comportement au sein du cops humain ainsi que leur profil toxicologique. Une analyse de simulations dynamiques a été utilisée pour l’enzyme 3HNR avec les meilleurs ligands actinomycétales en 50 ns pour confirmer la stabilité des complexes enzymes-ligand en analysant leurs RMSD, RMSF, Rg, SASA et le nombre de liaisons d’hydrogène. Les résultats ont confirmé la stabilité de ces métabolites lors de leurs interactions avec le site actif de l’enzyme 3HNR. Sur la base des résultats trouvés, les souches fongiques et actinomycétales isolées et caractérisées dans cette étude ainsi que les métabolites secondaires de ces deux groupes taxonomiques peuvent être exploitées comme des agents de biocontrôle efficaces contre le phytopathogène Alternaria. In this study, 68 fungal strains and 30 actinomycetal strains were isolated from three agricultural soils in order to evaluate their in vitro and in planta biocontrol activity against three strains of Alternaria sp. isolated from the fruits of infected tomatoes. Using the direct confrontation test, 9 fungal isolates and one actinomycetale isolate showed inhibition rates of mycelial growth of Alternaria strains varying between 53.33% and 92%. The micro-macroscopic characterization of the active strains allowed their attribution to the genera Aspergillus, Penicillium and Streptomyces. The analysis of the enzymatic potentials show that the antagonist strains possess an enzymatic arsenal linked to biocontrol including the enzymes amylase, protease, cellulase, lipase, esterase, pectinase, laccase and chitinase. The fermentation culture filtrates of the three best performing fungal strains showed Alternaria growth inhibition rates varying between 3.70% and 87.76% for different concentrations 10%, 20% and 40%. In the in planta test on tomatoes, these filtrates showed infection size inhibition rates varying between 55.56% and 100%. The 3D structures of the key enzymes involved in the virulence of Alternaria cystathionine beta lyase, homoserine O-acetyltransferase, glutathione reductase, pecate lyase, scytalone dehydratase, thioredoxin peroxidase, thioredoxin reductase, 3HNR and 4HNR have been modeled and their quality has been validated. 113 actinomycetal and 100 fungal secondary metabolites were analyzed for their inhibitory activity against enzymes modeled by molecular docking. The results allowed the selection of a large number of molecules with possible antifungal activity. A pharmacokinetic analysis of the Drug Likeness and ADMET characteristics of the promising metabolites made it possible to understand their behavior within the human body as well as their toxicological profile. Dynamic simulation analysis was used for the 3HNR enzyme with the best actinomycetal ligands in 50 ns to confirm the stability of the enzyme-ligand complexes by analyzing their RMSD, RMSF, Rg, SASA and number of hydrogen bonds. The results confirmed the stability of these metabolites during their interactions with the active site of the 3HNR enzyme. Based on the results found, the fungal and actinomycetal strains isolated and characterized in this study as well as the secondary metabolites of these two taxonomic groups can be exploited as effective biocontrol agents against the phytopathogen Alternaria.
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    Etude de l’activité antagoniste de souches fongiques et de pseudomonas SPP
    (Université Larbi Ben M'hidi Oum El Bouaghi, 2022) Saci, Feryal; Sabri, Imane; Benslama, Ouided
    Les pertes agricoles dus aux maladies fongiques représentent une inquiétude sérieuse qui occupe le monde entier. Les risques sanitaires et environnementale liés à l'utilisation des fongicides chimiques se posent dans plusieurs pays du monde. Les molécules bioactives d'origine naturelle sont une alternative idéale à ces produits chimiques conventionnelle. Dans cette étude nous avons recherché à isoler des souches Pseudomonas spp. et des souches fongique à partir de 3 échantillons de sol rhizosphérique de menthe, lentilles, et blé en vue de tester leur potentiel biofongicide contre l'isolat phytopatogène Alternaria sp. L'isolement a permis l'obtention de 10, 12, et 5 isolats, de chaque rhizosphère respectivement. Les isolats retenus ont été sélectionnés sur la base de leur aspect macro et microscopique en se référant aux caractères spécifiques des souches de Pseudomonas et des souches fongiques. Dans une deuxième étape des essaies d'antagonisme in vitro ont été menés selon la technique de confrontation directe sur gélose. Les résultats de ce test ont montré que la croissance mycélienne enregistrée chez les témoins est nettement supérieure à celle des couples Pseudomonas sp./Alternaria sp. Et champignon/Alternaria sp. Le test d'antagonisme in vitro a permis d'estimer le potentiel inhibiteur des isolats de Pseudomonassp.et souches fongiques vis-à-vis du phytopathogène. Cette évaluation a révélé des intensités inhibitrices variables selon la souche antagoniste.
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    Etude mycologique et mycotoxicologique des fruits secs (à coque) commercialisés au niveau de la région d’OUM El-BOUAGHI
    (Université Oum El Bouaghi, 2018) Dir, Khaoula; Boumaza, Khadidja; Benslama, Ouided
    Dans cette étude, nous avons contribué à la mise en évidence de la flore mycologique et de produits mycotoxicologiques de trois fruits à coques commercialisées dans la wilaya d'OEB: arachide, la noix et le noix de cajou. Les résultats obtenus montrent que les fruits à couques étudiés sont plus aux moins contaminés par différents souches fongiques avec unesupériorité apparente dans le noix avec 39% de nombre de souches totale contre seulement 33% et 28%pour l'arachide et la noix de cajou, respectivement. L'analyse de la flore fongique a montré une nette dominance du genreAlternaria (28%) suivie le genre Penicillium (17%), suivie le genre Aspergillus (11%), le reste des autres genres représente (44%). Lanoix semble être le plus contaminé par l'A. fumigatus et A. nigerproducteur d'AF et de l'A. ochraceus, producteur d'OTA, alors quela contamination du arachide et de noix de cajou, par ces isolats mycotoxinogène, est négligeable.
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    Evaluation du pouvoir antioxydant et antibactérien de quelques souches d’actinomycetes
    (Oum-El-Bouaghi, 2020) Beghou, Somia; Bouti, Nour El Houda; Benslama, Ouided
    La présente étude vise à évaluer le potentiel antimicrobien, antioxydant et des extraits bruts de quelques souches d’actinomycètes. Les stress oxydant est un type d’agression des constituants de la cellule dû aux (ROS). Les antioxydants sont une source importante et efficace contre le stress oxydatif, par leur capacité à réduire le niveau de radicaux libres dans la cellule à son intervalle normal ce qui protège la cellule contre plusieurs maladies. De même, La découverte et le développement de nouveaux antibiotiques pour traiter les infections bactériennes potentiellement mortelles est peut-être l'un des plus grand soucis actuel. Les actinomycètes, sont des sources pratiquement illimitées de nouveaux composés avec de nombreuses applications thérapeutiques. Ce sont les procaryotes les plus inestimables économiquement et biotechnologiquement; occupent une position de premier plan en raison de leur diversité et de leur capacité avérée à produire de nouveaux composés bioactifs.
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    Isolement, caractérisation et criblage de l’activité bioinsecticide d’isolats de Bacillus spp
    (Université de Larbi Ben M'hidi- Oum El Bouaghi, 2022) Ababsa, Amira; Mosbah, Radja; Benslama, Ouided
    Bacillus thuringiensis (Bt) est actuellement le microorganisme le plus utilisé en lutte biologique contre les insectes ravageurs et piqueurs en agriculture, en forêt, et en milieu urbain. Aucun incident lié aux formulations commerciales de Bt n'a été rapporté depuis plus de 40 ans, notamment pour les cultures maraîchères en conventionnel ou en agriculture biologique. De par son efficacité, son coût abordable et son utilisation simple par pulvérisation, ces agents de biocontrôle représentent actuellement la seule alternative aux traitements phytosanitaires chimiques pour la protection des cultures contre certains ravageurs. Dans cette étude, un isolement sélectif de souches de Bacillus a été réalisé à partir de plusieurs sol (Meskiana, Ain m'lila, et Dhalaa). Un total de 15 souches de Bacillus sp. ont été isolé. La caractérisation biochimique, morphologique et microscopique des isolats confirme leur appartenance au genre Bacillus. Les résultats biologiques contre les pucerons Aphis sp montrent que les souches A5, M2, M6, M1, A7, D5 ont entrainé la mort des insectes, ces isolats peuvent alors avoir d'une importance biotechnologique dans le domaine de biocontrôle contre les ravageurs agricoles. Le potentiel bioinsecticide de ses isolats mène à supposer qu'ils peuvent être membre de l'espèce Bacillus thuringiensis, mais d'autre analyses sont nécessaires pour la confirmation de cette supposition.
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    Les Points à risque de la contamination microbiologique de la viande bovine au niveau des abattoirs
    (Université Oum El Bouaghi, 2021) Berkani, Fouzia; Benslama, Ouided
    La viande a été traditionnellement considérée comme responsable d'un nombre conséquent de maladies d'origine alimentaire se déclarant chez les humains. Peuvent être contaminés par des souches pathogènes et provoquer des toxi-infections alimentaires. Le réservoir naturel de ces souches est le tractus gastro-intestinal du bovin. Les souches pathogènes ont une forte capacité de survie dans l'environnement de la ferme, processus d'abattage ainsi qu'au niveau d'obtention de la viande. Afin de réduire le risque de transmission à l'homme, Et de garantir la sécurité de la viande commercialisée, les abattoirs sont désormais tenus de mettre en place des méthodes , procédures de maîtrise de l'hygiène basées sur l'utilisation de la méthode HACCP qu'elle constituent un moyen proactif de contrôle des opérations visant à garantir la sécurité alimentaire dont le but d'analyse des risques, ont permis de réaliser avec succès le contrôle des risques a des niveaux prescrits pour la protection du consommateur.
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    L’Activité antagoniste des microorganismes endophytes contre les champignons phytopathogènes
    (Université Oum El Bouaghi, 2021) Berkani, Chayma Hibat Allah; Redjaimia, Intissar; Benslama, Ouided
    Les champignons phytopathogenes sont capables de mettre en place des processus infectieux complexes necessitant la differenciation de structures specialisees, une adaptation aux conditions nutritionnelles que constitue l¡¦hote vegetal, et enfin la mise en place de mecanismes permettant de contrer les reponses de defenses des plantes ,(attaquent surtout les parties aeriennes des plantes et colonisent donc toute la plante provocant des maladies telles que la fonte des semis, la pourriture vasculaire ou la pourriture des racines). Les degats causes sont le plus souvent observables sous forme de necroses localisees, avec developpement des myceliums en surface ou non, production intense de spores, et des signes caracteristiques de carences observables sur toute la plante (les principales maladies cryptogamiques du sol). En effet les endophytes jouent un role tres important comme moyen de lutte biologique : „S Protection contre Les predateurs. „S Les pathogenes. „S Les insectes. „S Production de composants d¡¦interets biotechnologiques (enzymes et medicaments
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    L’Activité antimicrobienne des champignons d’origine tellurique
    (Université Oum El Bouaghi, 2021) Hamza, Nour El Houda; Aloui, Halima; Benslama, Ouided
    Cette étude est une recherche bibliographique englobant des généralités sur les champignons et l'intérêt de leurs métabolites secondaires autant que substances à effet antimicrobiens. Les champignons sont des microorganismes divisée en trois catégories : les champignons filamenteux, les levures et les champignons supérieurs, et ils sont également appelés hétérotrophes. La plupart d'entre eux sont saprophytiques moins de 0.5% sont reconnus pathogène. Les champignons sont des producteurs prolifiques de métabolites secondaires qui produisent des antibiotiques, tels que la pénicilline, qui sont des produits chimiques qui attaquent la cellule bactérienne appelée bactéricide et empêchent son développement et sa reproduction. Ils ont aussi de nombreuses propriétés biologiques et ont un rôle important en médecine il est utilisé dans l'industrie pour produire de l'alcool, et en agriculture il est utilisé pour augmentent la fertilité du sol.
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    Optimisation de l’activité antibactérienne de quelques souches fongiques
    (Université Oum El Bouaghi, 2018) Soualmia, yassamine; Benchahla, Amina; Benslama, Ouided
    Le but de cette étude est d'optimiser l'activité antibactérienne de certaines souches fongiques isolées à partir du sol des différents endroits dans la wilaya d'Oum El-bouaghi, au laboratoire de microbiologie à l'université Larbi Benmhidi. L'étape d'isolement dans les milieux sabouraud et PDA a permis d'isoler plus de vingt-trois souches fongiques. L'identification micro et macroscopique a permis de mettre en évidence plusieurs genres comme: Aspergillus, Alterneria, Penicillum ,Rhizopus,…. La mise en évidence de l'activité antibactérienne des isolats est réalisée par la technique des cylindres d'agar sur trois souches bactériennes une à GRAM positif :Staphylococcus aureus,et deux autres à GRAM négatif : Escherichia coli et Pseudomonas aeruginosa , le résultat positif a été seulement obtenu avec la bactérie " P. aeruginosa ", une zone d'inhibition importante a été obtenue par la souche fongique " Rhizopus" , c'est pour cela qu'elle a subit d'une fermentation avec différents milieux de culture liquides : PDB, Czapek dox et Sabouraud suivit d'une extraction par quatre solvants : Acétate d'éthyle ,Chloroforme, Toluène et Hexane, puis l'extrait a fait l'objet d'un test sur P.aeruginosa par la technique des puits et la technique des disques ; les résultats obtenus par la première sont : environ(0-1.8cm) et pour la deuxième sont environ (0.8-1.3cm). Une étude statistique faite par ANOVA à deux facteurs sans répétitions a été réalisée. Le milieu de culture et le solvant étaient les deux facteurs de l'étude. Les résultats obtenus n'ont permis de mettre en évidence aucune interaction entre ces deux facteurs et qu'ils n'ont aucune influence sur l'activité antibactérienne de l'espèce Rhizopus ce qui reste à confirmer par d'autre études.